前任校长金耀基教授誉之为「香港第二景」的合一亭，位于新亚书院学生宿舍学思楼与知行楼之间。此亭之兴建乃为纪念新亚书院创办人钱穆先生及其所著〈天人合一论〉。天人合一说是儒家学说的核心观念，意谓人道、天道相通不隔。合一亭选址巧妙，「一池清水，二树半抱，非传统园林，有现代笔意。」亭前水池更可营造水天一色的效果，表达天人合一的意念。亭外墙上所刻钱穆先生的〈天人合一论〉及「天人合一」印章，分别是艺术系李润桓教授和唐锦腾教授的作品。