前任校長金耀基教授譽之為「香港第二景」的合一亭，位於新亞書院學生宿舍學思樓與知行樓之間。此亭之興建乃為紀念新亞書院創辦人錢穆先生及其所著〈天人合一論〉。天人合一說是儒家學說的核心觀念，意謂人道、天道相通不隔。合一亭選址巧妙，「一池清水，二樹半抱，非傳統園林，有現代筆意。」亭前水池更可營造水天一色的效果，表達天人合一的意念。亭外牆上所刻錢穆先生的〈天人合一論〉及「天人合一」印章，分別是藝術系李潤桓教授和唐錦騰教授的作品。